新築住宅の供給者である建築業者が負うべき瑕疵担保責任をバックアップするための制度で、住宅保証機構に登録している業者が建てた、新築一戸建てなどが保証の対象になる。登録している建築業者は設計・施工基準を守って工事をし、工事中2回以上、専門検査員による現場審査を受ける。合格した住宅については、引き渡し時に、無料修補の内容が明記された保証書が発行され、万一不具合が生じた場合にかかる補修費用などを同機構が保証する。保証期間は構造躯体などは10年間、そのほかの部位は1〜2年間。